企业可能会放弃低税率的原因包括：
减税金额小：
企业可能认为减税金额不足以弥补实施减税优惠的成本和麻烦。
会计处理问题：
部分小企业聘请的代帐会计可能为图省事，擅自放弃减税优惠。
前期预缴税款过多：
部分企业因前期预缴税款金额大，担心税务局办理退税前会查账，审查严格不仅不能享受减税优惠，还可能多缴税。
退税流程复杂：
企业可能认为退税流程复杂且成本效益不高，相比之下，免税处理起来更简单。
进项税额不足：
适用零税率的企业，如果进项税额较少，可能会发现免税比退税更划算，因为不得免抵的进项税额可能会大于退税额。
其他收入影响：
企业做免税服务时，如果有其他不免税的增值税收入，可能会因为需要转出免税服务的进项税额而导致实际税负增加。
政策适用问题：
有些企业可能不符合享受低税率政策的条件，或者政策适用存在限制，导致企业选择放弃这些优惠。
综上所述，企业放弃低税率的原因多种多样，主要是基于经济利益、税务成本、流程复杂度以及政策适用等方面的考虑。