菏泽的别墅小区主要分布在以下几个区域：
牡丹区
菏泽中心：位于市委市政府南侧，主城区核心板块，四面环路，北侧毗邻中华路、南侧毗邻中山路、西侧毗邻府南街，周边紧邻菏泽市重点学校菏泽市实验小学。
菏泽恒大华府：地处城市东拓主轴之上，雄踞牡丹区老城核心，选址赵王河畔，紧扼城市交通动脉——黄河路，三纵三横立体路网相接全城。
曹州毛胡同：位于牡丹区长城东路路段，毗邻牡丹小学、曹州牡丹园、菏泽银座和谐广场，整体采用新中式建筑风格，整体无高层建筑，最高建筑仅9层，容积率1.13。
玫瑰园：位于菏泽牡丹区菏鄄路和北外环交汇处，七里河北侧路西，主推建面约308-345㎡户型。
凯兴璞园：位于菏泽牡丹区广福大街与思源桥交口西北方向，主推建面约463㎡户型。
鲁西南温泉院子：位于菏泽开发区广州路与珠江路交汇向东200米（鲁西南温泉水世界东临），主推建面约为242-525㎡户型。
南环一号院：位于巨野县金港路，在售别墅，人车分流，低总价。
方信·江山墅：位于菏泽城区西部，与银田农贸城、毅德城、红星美凯龙直线距离200米，与西苑小学一墙之隔，对望千亩湿地公园万福河湿地公园。
开发区
鲁西南温泉水世界：位于菏泽开发区广州路与珠江路交汇向东200米，东临，主推3室/4室/5室/6室，建面约242-525㎡别墅。
南环一号院：位于巨野县金港路，在售别墅，人车分流，低总价。
巨野县
洙水河公园光明路桥北：位于菏泽巨野洙水河公园光明路桥北66米西侧，主推3室/4室/10室，建面约170-216㎡别墅。
人民路3419号、 文庙西路、 北园路、 麒麟大道：均位于巨野县，提供不同户型和价格的别墅。
郓城县
郓城县：有多个别墅小区上榜，但具体小区名称和位置未详细列出。
曹县
曹县：有少量别墅小区上榜，但具体小区名称和位置未详细列出。
总的来说，菏泽的别墅小区主要集中在牡丹区和开发区，尤其是牡丹区，拥有较多的别墅项目。这些别墅小区多采用新中式建筑风格，提供大户型和高端配套设施，适合不同层次的需求。建议根据个人需求和预算，选择合适的别墅小区进行购买或了解。