工程合作的利润分配可以根据多种因素进行协商确定，以下是一些常见的分配原则和建议：
出资比例
利润分配可以按照各方的出资比例进行分配。例如，如果一方出资60%，另一方出资40%，则利润也按照这个比例分配。
劳务费用和成本
除了出资比例外，还需要考虑劳务费用和成本。这些费用应该从总利润中扣除，剩余部分再按照各方的出资比例或协商确定的比例进行分配。
利润分成
利润部分通常建议五五分成，但也可以根据双方的协商结果进行调整。例如，如果出资方愿意给另一方六成利润，也是可以的。
综合资源占比
在一些情况下，可以根据各方的综合资源占比进行分配，例如创始人的股权比例可能会更高一些，因为他们通常是公司的总经理和主要管理者。
项目来源和管理
如果某个合伙人负责找项目，可以适当考虑多给一些股份。同样，如果某个合伙人在工程施工管理中起到关键作用，也可以考虑多给一些股份，相当于技术入股。
法律和合同
在分配利润时，还需要遵守相关法律法规和合同条款。例如，《建筑法》规定，建筑工程总承包单位可以将部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位，但必须经建设单位认可。
灵活性和可调整性
分配方案应具有一定的灵活性和可调整性，以应对项目需求和情况的变化。例如，如果某个任务需要更多资源，可以重新分配任务和股份。
记录和沟通
合伙做生意一定要记好账，包括各自出了多少钱、垫付了多少材料费、人工费、收到了多少拨款等，然后按照出资比例去分配利润，以减少因利润分配不均而产生的矛盾。
建议
充分协商：在合作开始前，合伙人之间应该充分协商，明确各自的权益和责任，确保分配方案公平合理。
合同保障：将分配方案以合同形式固定下来，避免后期出现纠纷。
透明管理：保持财务透明，定期向合伙人报告财务状况，增强信任。
灵活调整：根据项目实际情况和需求，适时调整分配方案，确保合作顺利进行。
通过以上原则和措施，可以有效地分配工程合作的利润，保障各方的权益，促进合作的长期稳定发展。