公司股份的分配通常遵循以下原则：
出资比例原则：
股份的分配一般按照股东认缴或认购的股份在公司股本总额中所占的比例进行分配。这意味着，股东按照其实缴的出资比例分取红利，并在公司新增资本时，有权优先按照实缴的出资比例认缴出资。除非全体股东另有约定。
法定优先权：
根据《中华人民共和国公司法》第三十四条的规定，股东按照实缴的出资比例分取红利，并在公司新增资本时，有权优先按照实缴的出资比例认缴出资。除非全体股东约定不按照出资比例分取红利或者不按照出资比例优先认缴出资。
约定优先原则：
如果全体股东有另外的约定，比如不按照出资比例分取红利或者不按照出资比例优先认缴出资，那么可以按照这些约定进行股份分配。
其他因素考虑：
股份分配也可以考虑其他因素，如股东的劳务支出、对公司的贡献等。这些因素可以在股东之间协商确定，并签署相关协议。
公司章程规定：
公司章程可以对股份分配做出特别规定，除非公司章程有特别约定，否则股份分配应遵循《公司法》的相关规定。
股权分配方式：
股权分配可以采取平均分配、个人独大或差异化分配等方式。具体选择哪种方式，需要根据公司的实际情况和股东之间的协商结果来确定。
创始人股权保护：
在创业初期，创始人通常需要保持一定的股权比例，以保障其对公司的控制权。具体的股权比例可以根据创业人数等因素进行调整。
综上所述，公司股份的分配主要按照股东的出资比例进行，同时也考虑其他因素和股东的约定。在实际操作中，建议股东之间充分协商，并在公司章程中明确规定股份分配的具体原则和方式，以减少未来可能出现的纠纷。